T.P. Connectivité fonctionnelle

jeudi 24 juin 2010
par Jean-Luc Anton

Analyses de connectivité fonctionnelle en IRMf

Travaux Pratiques - niveau avancé

Du 29 septembre au 1er octobre 2010, Marseille

Dans la continuité directe de la formation théorique JIRFNI "IRMf niveau avancé" de mai 2009 à Marseille, les objectifs généraux de ces trois jours de Travaux Pratiques sont :

■ savoir définir les questions cognitives qui peuvent être abordées par les approches de connectivité fonctionnelle en IRMf

■ savoir choisir le(s) protocole(s) de stimulation et d’acquisition IRMf adaptés ainsi que les logiciels / méthodes appropriées, en fonction des questions cognitives d’intérêt

Voir en bas de page deux photos et l’affiche de la formation.


Programme, informations et supports de cours à télécharger (bouton de droite de la souris, enregistrer la cible du lien sous …)

Mercredi 29 Septembre 2010 : Pierre Fonlupt

10h – 10h30 : Présentation des différentes méthodes pour mesurer la connectivité. Voir cours de la formation de Mai 2009 : JIRFNI_Marseille_Fonlupt_Connectivite.pdf (0,9 Mo).

Préparation des données (cf fichiers matlab mis à jour dans synthetique.rar (0,2 Mo)).

10h30 – 12h45 : Exemple synthétique avec un protocole en bloc (jirfni1m.m et jirfni1_avec_spm.m) et un protocole évènementiel ( jirfni_complexe.m)

12h45 – 14h15 : Repas

14h15 - 15h00 : Vérification des séries temporelles (acp.m)

15h00 – 18h00 : Structural Equation Modeling (SEM) avec Amos. Voir cours de la formation de Mai 2009 : JIRFNI_Marseille_Fonlupt_SEM.pdf (0,6 Mo). Voir également la documentation : Amos 16.0 User’s Guide.pdf (5,7 Mo). La version libre du logiciel Amos Student est disponible ici : http://www.amosdevelopment.com/download/ Le logiciel Amos payant est disponible ici : http://www.spss.com/amos/

Jeudi 30 Septembre 2010 : Pilar Salgado Pineda

10h – 12h45 : Psycho-Physiological Interaction (PPI) sous spm8. Voir documentation : chapitre 33 du manuel spm8 (0,6 Mo), extrait du manuel complet de spm8 disponible sur le site de spm (http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/do...). Voir également la présentation de Pilar Salgado Pineda : TP_PPI.ppt (0,8 Mo). Voir enfin le cours sur la PPI trouvé par Patricia Romaiguère : http://www2.fmrib.ox.ac.uk/Members/... et http://www2.fmrib.ox.ac.uk/Members/...

12h45 – 14h15 : Repas

14h15 - 18h00 : Connectivité fonctionnelle entre une région et le reste du cerveau : Toolbox « conn » de spm8. Voir documentation : conn.pdf (0,6 Mo). Voir également la présentation de Pilar Salgado Pineda : TP_conn.ppt (1,3 Mo).

Vendredi 1er Octobre 2010 : Vincent Perlbarg

10h – 12h45 : Analyse de connectivité fonctionnelle, analyse en composantes indépendantes avec le logiciel NetBrainWork. Le logiciel est disponible ici : http://sites.google.com/site/netbra.... Voir documentation spécifique pour les TPs : TP_NBW.pdf (0,9 Mo). Voir également la présentation de Vincent Perlbarg de Mai 2009 ([JIRFNI_Marseille_Perlbarg_Connectivite_Fonctionnelle.pdf (3,6 Mo) -> http://irmfmrs.free.fr/Uploads/JIRF...

JPEG - 31.5 ko

JPEG - 30.1 ko


Documents joints

T.P. JIRFNI Analyses Connectivite Fonctionnelle
T.P. JIRFNI Analyses Connectivite Fonctionnelle